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Matplotlib 常用画图命令总结:使用 Python 在论文中画出一手漂亮的数据图

Matplotlib 常用画图命令总结:使用 Python 在论文中画出一手漂亮的数据图

介绍

本文不是一篇详尽的、从简到繁的 Maplotlib 画图教程,而是用各种例子快速直观地让读者上手 Matplotlib 画图中的一些常用的、基础的操作。本文不对各种数据图(折线图、柱状图等)作介绍。文中配有效果示意图及代码。本文亦可作常用画图函数/参数查询之用。


PS:知乎的编辑器真是弱的可怜,建议去 CSDN 看:

什么样的数据图才是好的?

图之好坏不在繁简,一副好图,应该让读者能清晰明了地理解你想要表达的意思。所以在设计图的时候,此为第一要义。

检查你的数据图

  • 是否对色盲友好?(避免过多地使用红绿配色。
  • 如果打印成黑白稿(grayscale)的话,读者是否还能分辨出不同的元素?(避免仅使用颜色来区分元素,使用恰当、对比度高的颜色,以及 Marker、线的样式、粗细等
  • 图片的质量是否足够高?(PDF、EPS 等矢量图、分辨率高的 PNG、JPG
  • 标题、标签、刻度、图例是否正确,表达清楚?(最好不要仅使用数学符号来表示轴标签,例如 \alpha\beta 等,使用明确的文字来描述。
  • 使用的字体与正文是否一致?

基础知识

在介绍其他内容之前,我们先回顾一下基础知识,这里借用 Matplotlib 文档的一张图 [1]:

图中共标出了14种概念:

  1. Figure - 画板
  2. Title - 标题
  3. X axis label - X轴标签
  4. Y axis label - Y轴标签
  5. Legend - 图例
  6. Major tick label - 主刻度标签
  7. Minor tick label - 次刻度标签
  8. Grid - 网格
  9. Line (line plot) - 线
  10. Markers (scatter plot) - 标记
  11. Major tick - 主刻度
  12. Minor tick - 次刻度
  13. Axes - 轴
  14. Spines - 脊

这些基础概念十分有用,希望大家能记住其作用及对应的英文。如果遇到更复杂的需求,可以直接在官网文档中进行查询。

环境

  • Python 3.7.3
  • Matplotlib 3.1.3

常用链接

颜色 Colors: - Choosing Colormaps in Matplotlib - List of Named Colors - HTML Color Picker - Color Brewer 2.0 - How to find a color scheme that's also useful when printed in black and white?

线样式: - Linestyle - Line2D

标记样式: - Markers - Marker filling

刻度: - Tick Locators - Tick Formatters

图例Legend Guide


正文

开始画图

import matplotlib.pyplot as plt  # 之后的代码默认引入此包

Figure 画板

创建一个简单的画板并展示

fig, ax = plt.subplots()

plt.show()  # 之后的代码默认省略此步骤

设定画板的长宽figsize

fig, ax = plt.subplots(figsize=(12, 3))

设定子图

fig , ax = plt.subplots(nrows=3, ncols=5)

nrowsncols参数分别为行数和列数。更复杂的例子请参考官网教程

访问不同的字图

假设现在有三行五列:

ax[0, 4].plot(x, y, color='limegreen')
ax[2, 2].plot(x, y, color='red')

紧凑布局 Tight Layout

fig, ax = plt.subplots(tight_layout=True)

画板背景色

ax.set_facecolor('lightblue')

图中图 Inset

ax.plot(x, y, color='limegreen', label='Xovee')
inset = plt.axes((.5, .5, .3, .3), facecolor='lightblue')
inset.plot(x, y, color='red')

标签 Label

设定图片的轴标签、标题、字体颜色、字体大小

  • plt.title()
  • plt.xlabel()plt.ylabel()
  • plt.set_title()
  • ax.set_xlabel()ax.set_ylabel()
ax.set_title("Xovee's Figure", fontsize=24, color='red')
ax.set_xlabel('Xovee', fontsize=20, color='lightblue')
ax.set_ylabel('Xovee', fontsize=20, color='coral')

轴 Axes/Axis

设定轴的范围

ax.set_xlim(np.pi, 3*np.pi)
ax.set_ylim(-.5, .5)

设定轴的缩放 Scale

可选项包括: - linear默认 - log - symlog - logit

fig, ax = plt.subplots(ncols=2, figsize=(8, 4), tight_layout=True)

x = np.linspace(0, 100, 1000)
y = [2**x_ for x_ in x]

ax[0].plot(x, y, color='limegreen', label='Xovee')

ax[1].plot(x, y, color='coral')
ax[1].set_yscale('log')

设定轴的上下界、粗细、颜色

ax.plot(x, y, color='limegreen', label='Xovee')
ax.set_yticks([-.5, 0., .5])
ax.set_xticks([2, 4, 6, 8])

ax.spines['top'].set_visible(False)
ax.spines['right'].set_visible(False)
ax.spines['left'].set_bounds(-.5, .5)
ax.spines['bottom'].set_bounds(2, 8)

ax.spines['bottom'].set_linewidth(2)
ax.spines['bottom'].set_color('red')

隐藏轴

hide_axes = ['left', 'top', 'right', 'bottom']
for axis in hide_axes:
    ax.spines[axis].set_visible(False)

读者可以关注一下这个ax.spines,即轴的脊椎,将其可见度设为False

设定右(上)坐标轴

ax.twinx(),同理可以设置上坐标轴ax.twiny()

ax.plot(x, y, color='limegreen', label='Xovee')
axr = ax.twinx()
axr.set_yticks([.5])
axr.set_yticklabels(['Xovee'])

Tick 刻度

设置刻度的长、宽、颜色

# axis 默认是 both, 或者 x 和 y
# which 可以是 major, minor, both
ax.tick_params(axis='both', which='major', color='blue', length=10, width=3)

自定义刻度的位置和标签

  • plt.xticks()plt.yticks()
  • ax.set_xticks()ax.set_xticklabels()
  • ax.set_yticks()ax.set_yticklabels()
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np


fig, ax = plt.subplots(tight_layout=True)

x = np.linspace(0, 4*np.pi, 100)
y = np.sin(x)

plt.plot(x, y, color='limegreen', label='Xovee')
plt.xticks([0, np.pi, 2*np.pi, 3*np.pi, 12], ['0.0', '$\pi$', '$2\pi$', '3$\pi$', '12'], fontsize=16, rotation=30, color='red')
plt.yticks([-1, 0, 1], fontsize=16, color='blue')

plt.show()

显示(隐藏)主/次刻度

右轴显示minor次刻度,下轴不显示minor次刻度。

ax.set_xticks([1e1, 1e2, 1e4], minor=True)
ax.set_yticks([1e-4, 1e-2, 1e0], minor=False)

Legend 图例

设定图例位置和文字大小

loc的可选参数包括best, lower, upper, center, left, right及其部分组合例如lower left

plt.legend(loc='lower center', fontsize=24)

设定图例位置

bbox_to_anchor参数的四元组,以左下角为参照,设定图例的位置:

plt.legend(loc='lower left', bbox_to_anchor=(0, 1.05, .5, 1.05),  fontsize=24)

多行多列图例、图例背景颜色

legend = plt.legend(loc='lower left', ncol=3, fontsize=16)
legend.get_frame().set_facecolor('linen')

网格 Grid

fig, ax = plt.subplots(ncols=3, tight_layout=True)

x = np.linspace(0, 4*np.pi, 100)
y = np.sin(x)

ax[0].plot(x, y, color='limegreen', label='Xovee')
ax[1].plot(x, y, color='red', label='Xovee')
ax[2].plot(x, y, color='blue', label='Xovee')

ax[0].grid(axis='x', linestyle='--')
ax[1].grid(axis='y', linewidth=5)
ax[2].grid(color='purple')

其他命令

减小生成的文件大小

添加rasterized=True参数。

plt.plot(x, y, rasterized=True)
plt.scatter(x, y, rasterized=True)
...

文字 Text

ax.text(2, 0, 'Xovee Xu is watching you!!!', fontsize=12, weight='bold', color='Coral')

设定字体

from matplotlib import rcParams
rcParams['font.family'] = 'Times New Roman'

使用 TrueType 字体(或避免 Type 3 字体)

第一种方法是更改配置文件,即默认之后所有的画图都使用 TrueType 字体:

  1. 首先找到并修改`matplotlib`文件
  2. 如果你不知道该文件的位置,在 python 中输入以下命令 [2]
>>> import matplotlib
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
'/home/foo/.config/matplotlib/matplotlibrc'

3. 修改以下两项即可 [3]

pdf.fonttype : 42
ps.fonttype : 42

第二种方法是在单个画图代码中使用如下命令:

import matplotlib

matplotlib.rcParams['pdf.fonttype'] = 42
matplotlib.rcParams['ps.fonttype'] = 42

设定层级 zorder

zorder高的元素显示在zorder低低元素之上。

ax[0].scatter([0], [2], s=1e5)
ax[0].scatter([0], [0], s=1e5, c='red')
ax[1].scatter([0], [2], s=1e5, zorder=5)
ax[1].scatter([0], [0], s=1e5, c='red', zorder=3)

透明 alpha

设定alpha参数,1为不透明,0为完全透明。

ax.scatter([0], [2], s=1e5, c='green', alpha=.5)
ax.scatter([0], [0], s=1e5, c='yellow', alpha=.5)
ax.scatter([-1], [1], s=3e4, c='red', zorder=0)
ax.scatter([1], [1], s=3e4, c='blue', alpha=1.)

设置颜色地图:例一 colormap

各种colormap颜色参考值可以在这里找到。

fig, ax = plt.subplots(tight_layout=True)

x = np.linspace(0, 4*np.pi, 100)
y = np.sin(x)

cmp = plt.cm.get_cmap('rainbow')

for i in range(len(x)-1):
    plt.plot([x[i], x[i+1]], [y[i], y[i+1]], linewidth=5, color=cmp(x[i]/max(x)))

设置颜色地图:例二 colormap

ax.scatter(x, y, s=x**2, c=y, cmap='rainbow')

打印出系统中支持的字体名

import matplotlib.font_manager

a = sorted([f.name for f in matplotlib.font_manager.fontManager.ttflist])

for i in a:
    print(i)

Reference

  1. Usage Guide. (Mar 20, 2020). Retrieved from matplotlib.org/tutorial
  2. Customizing Matplotlib with style sheets and rcParams. (Apr 8, 2020). Retrieved from Customizing Matplotlib with style sheets and rcParams
  3. Jamie Oaks. (Mar 1, 2014). Avoiding Type 3 fonts in matplotlib plots. Retrieved from Avoiding Type 3 fonts in matplotlib plots
编辑于 2020-05-20 22:11