用image j测量特定区域面积占总面积的比例

用image j测量特定区域面积占总面积的比例

ImageJ(官网:imagej.nih.gov/ij/)是一个基于java的公共的图像处理软件,它是由National Institutes of Health(NIH)开发的一款功能强大的免费软件,在生物及医学图像分析中起着非常重要的作用。 ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,打印8位,16位,32位的图片, 支持TIFF(默认的文件格式,无损压缩格式, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。Imagej 的高级功能均依靠插件来实现,Imagej插件下载地址imagej.nih.gov/ij/plugi。大家可以根据自己的需要进行相关下载。网上有关Imagej的教程和操作方法有很多,有兴趣的朋友可以自行学习。

在此有兴趣交流的朋友,欢迎加入ImageJ使用交流互助群,群号码:557522488,大家一起进步!

下面我们用Imagej来测量特定区域面积占总面积的比例:

首先将蓝色区域进行分离,如下图:我们将图片中的蓝色完全的提取出来了。

调节阈值,将所有蓝色进行选定,选中以后为红色。

得到蓝色区域的面积为48396平方像素。

整个区域进行选定,测量其面积为147373平方像素,由此我们得到了我们的题目要求。

一个其他的例子:

我在土豆网上还上传了其他的视频,http://www.tudou.com/my/center/item/itemList.do
1、利用IMaris软件分析神经元
2、imageJ分析神经突起长度
3、ImageJ中RetFM-J插件分析分析HE染色图片
4、ImageJ对荧光图片进行半定量分析
5、IPP划线看荧光强度用Origin作图

欢迎各位交流指正。

ps:

荧光共定位分析


追踪神经元形态:

数细胞,并分割相连细胞:

计算划痕实验面积:

多孔粒子的直径分布:

编辑于 2016-08-02