与心理学数据分析相关的R工具包
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为下周末的R语言会议热个身，写下自己收集的心理学研究的数据分析相关的R包。
R语言做统计已经慢慢成为（国际）心理学的主流了，国内由于盗版SPSS的长期存在，严重阻碍了心理学研究者使用R的步伐。当然，考虑到大部分心理学研究生既怕数学又怕写（简单的）代码（玩笑哈，别太当真），即便在心理学强大的美国，使用R也是一件需要大力去提倡的事情。比如美国心理学会（Association for Psychological Science, APS）针对会员的月刊Observer的三月刊中，就专门推R的使用：Association for Psychological Science。
我去年上半年在国外交换时，正好时间比较空闲，于是花了大量的时间把自己之前使用SPSS做的分析全部换成了R，慢慢了收集了一些心理学数据分析中能够用到的R包，分享一下，因为好像这些R语言会议上我们不会讲这些包的使用，而主要讲一些R使用的大致方法。欢迎大家补充，一起完善。
当然，有许多通用的包在心理学数据分析中也非常重要，比如ggplot2等，在这里就不说了。
Survey Data:
psych: personality and psychological research
SEM:
lavaan: latent variable analysis
OpenMx
Experimental data (RT)
ez: easy way to analyze factorial design data.（hcp:做重复测量方式分析的不二选择）
jmv: 这个即有R包也有GUI的软件，适合刚从SPSS转过来的同行
trimr: trim reaction times data.
TOSTER: equivalence test
BootES:使用bootstrap的方式计算效应量及其置信区间https://cran.r-project.org/web/packages/bootES/index.html
effsize: calculate Cohen's d and confidence intervals
CRAN - Package effsize
compute.es: compute effect size.
CRAN - Package compute.es
lsr: Effect size calculations for ANOVAs
CRAN - Package lsr
Linear Mixed-Effects Models
lme4: CRAN - Package lme4
nlme: CRAN - Package nlme
multinormial model
TreeBUGS: CRAN - Package TreeBUGS
ex-Gaussian model:
retimes:CRAN - Package retimes
Drift Diffusion Model:
RWiener: CRAN - Package RWiener
Meta-analysis:
关于使用R做元分析有一个专门的页面：CRAN Task View: Meta-Analysis
mvmeta: Multivariate and Univariate Meta-Analysis and Meta-Regression
CRAN - Package mvmeta
metacor: Meta-analysis of correlation coefficients
CRAN - Package metacor
metafor:
The metafor Package
metaSEM: 用SEM的方法来做元分析。
related packages: heplots, BaylorEdPsych
Bayesian Stats:
BayesFactor：http://bayesfactorpcl.r-forge.r-project.org/
BEST（Bayesian Estimation Supersedes the t-Test）：CRAN - Package BEST
BANOVA
CRAN - Package BANOVA
BayesMed:CRAN - Package BayesMed
Notes on the use of R for psychology experiments and questionnaires by Jonathan Baron
Notes on the use of R for psychology experiments and questionnaires Manuscript preparation
papaja：crsh/papaja
apaTables： CRAN - Package apaTables Check Statistics
R package “statcheck”: Extract statistics from articles and recompute values (Epskamp, S., & Nuijten, M. B., 2015)
statcheck: Exact statistic from articles and recompute values
statcheck Visualization
YaRrr: more information than bar graph
ndphillips/yarrr
国内其实有一个使用R和开发R包的心理学团队，欢迎大家关注：PsychoR.club。
